Werner Leuthard war Konditionstrainer unter Trainer Joachim Löw bei Austria Wien und kam vom VfB Stuttgart. Als der VfB Stuttgart wegen einer Vertragsverlängerung mit Leuthard zögerte, schlug Löw zu. Ehe sich der VfB und die Konkurrenz versah, hatte Leuthard, mit dem Löw schon den FC Tirol zur Meisterschaft geführt hat, in Wien unterschrieben. Im Sommer 2004 ging er gemeinsam mit Felix Magath zum FC Bayern München. Von da an gehörte er zum Trainerteam von Magath und wechselte immer mit Cheftrainer den Verein.
Stationen als Konditionstrainer:
Konditionstrainer im deutschen Tennis Federations-Cup-Team (1992 - 1997), persönlicher Fitnesscoach für Fredi Bobic (1999), SpVgg Unterhaching (1999 - 2001), FC Tirol (2001 - 2002), VfB Stuttgart (2002 - 2003), Austria Wien (2003 - 2004), FC Bayern München (Sommer 2004 - Jänner 2007), VfL Wolfsburg (2007 - 2009), FC Schalke 04 (Sommer 2009 - März 2011), VfL Wolfsburg (18. März 2011 - 25. Oktober 2012), FC Fulham (14. Februar - 18. September 2014), FC Basel (2016 - 2018), Eintracht Frankfurt (2018/19), FC Schalke 04 (ab Sommer 2020)